萬(wàn)歷四十二年(1614年),朝廷敕賜海會(huì)寺新名“萬(wàn)善寺”,并頒大藏經(jīng)卷,但丹陽(yáng)民間仍習(xí)慣稱“海會(huì)寺”。同一時(shí)期,丹陽(yáng)地方人士為“鎮(zhèn)風(fēng)水”,在丹陽(yáng)東門古運(yùn)河畔興建寶塔,因此地臨近萬(wàn)善寺,修建的寶塔被命名為“萬(wàn)善塔”。明天啟末年,丹陽(yáng)開(kāi)工建萬(wàn)善塔,至明崇禎十年(1637年)建成。塔身7層,高47.76米,為木檐樓閣式,平地而起,直上蒼穹,故又稱"通天塔"。按層建成塔室,外觀為8面,各層均有外廊。各室架有木梁,上鋪樓板,有木扶梯按層折上。
萬(wàn)善海會(huì)寺建成后,一度香火旺盛,1644年,明朝滅亡,清朝建立,萬(wàn)善海會(huì)寺正常運(yùn)行。清康熙二十年,寺廟大殿毀于火災(zāi),僧寶相募建。此后的100多年,中國(guó)經(jīng)歷了康乾盛世,社會(huì)穩(wěn)定,經(jīng)濟(jì)繁榮,萬(wàn)善海會(huì)寺得到了快速發(fā)展,高僧輩出,寺名遠(yuǎn)播數(shù)百里。至清朝末年,太平天國(guó)農(nóng)民起義爆發(fā),咸豐庚申(1860年),天平軍攻占丹陽(yáng)城,縣城遭到嚴(yán)重破壞,在這次戰(zhàn)火中,萬(wàn)善海會(huì)寺遭到毀滅性破壞。
同治四年(1864年),丹陽(yáng)重新被清軍占領(lǐng),這時(shí)的萬(wàn)善海會(huì)寺已是“荊棘縱橫,瓦礫堆積”。上升授權(quán)寬鴻重新募建,歷盡艱辛,從同治六年(1866年)至光緒九年(1883年)這十八年中,恢復(fù)了寺廟百分之九十的建筑,只有藏經(jīng)樓尚未告成。為了表彰功德,啟迪后人,第二年,丹陽(yáng)地方紳士徐錫麟等人特意撰文并刻寫了《重建萬(wàn)善禪寺碑記》,豎立在寺內(nèi)。碑高2.5米,碑寬0.50米,碑首雕刻著“二龍戲珠”圖案,上刻“十方常住,重建碑記”八個(gè)楷體大字。到抗日戰(zhàn)爭(zhēng)爆發(fā)前夕,萬(wàn)善海會(huì)寺寺院保存完好,時(shí)為丹陽(yáng)名寺之一。
新海會(huì)寺于2009年11月18日正式奠基動(dòng)工,新建海會(huì)寺位于萬(wàn)善塔之東南地塊,呈倒梯形,總用地面積約95.9畝,總建設(shè)面積63983平方米,總投資約1億元。海會(huì)寺西北側(cè)還將與
萬(wàn)善公園的水面相通,由橋梁溝通,其他三面均與城市道路相接。由于采用與傳統(tǒng)佛寺制式有傳承的軸對(duì)稱格局,寺廟以對(duì)稱軸為中心依次展開(kāi)
而此次院方運(yùn)用了60只KSOUND MD系列音箱

、SAILTEN無(wú)線會(huì)議通信、BOSWELL博士威爾的發(fā)言系統(tǒng)用來(lái)構(gòu)造整個(gè)音頻系統(tǒng)。經(jīng)過(guò)院方實(shí)際講經(jīng)使用后,一致高度評(píng)價(jià)了這套系統(tǒng)。
